Para saber qual é o seu CNAE preponderante, você tem que consultar no seu cartão de CNPJ qual das atividade que consta no cartão, que você tem o maior nº de funcionários, para consultar o cartão você vai em: http://www.receita.fazenda.gov.br/PessoaJuridica/CNPJ/cnpjreva/Cnpjreva_Solicitacao.asp 

O FAP, você tem que cadastrar uma senha que pode ser on line (lembrando que o site está congestionado), onde você vai consultar o FAP específico da sua empresa http://www2.dataprev.gov.br/pls/fap/pkg_cfc_acesso.pr_acessa_empresa nesta página você tem como cadastrar a senha e consultar o FAP de sua empresa.

Para saber o RAT, deve consultar o  Anexo V do Decreto 3048/99, em vigor a partir de 01/01/2010 http://www81.dataprev.gov.br/sislex/paginas/23/1999/ANx3048.htm#anx_5 e o FPAS você consulta na seguinte tabela http://www.receita.fazenda.gov.br/publico/Legislacao/Ins/2009/Anexo1INRFB971.doc pelo CNAE preponderante.

OBS.: NÃO UTILIZAR O RAT DO ANEXO I DA IN 971, POIS ESTÁ DESATUALIZADO COM O ANEXO V DO DECRETO 3048/99 

Na SEFIP, para você colocar o CNAE preponderante você vai na aba CADASTRO, clica em cima da empresa, alterar e coloca o que CNAE preponderante, mas detalhe seleciona na lista deles, porque se você digitar dá inválido. 

Para colocar o FAP, vai à aba MOVIMENTO e clica em cima da empresa, então clica no botão DADOS DO MOVIMENTO, e digita a alíquota do FAP da sua empresa, ainda somente com 2 dígito sem arredondar, somente desprezando as duas últimas casas e salva. Pode gerar sua SEFIP. Não utilizar a GPS do sistema caso tenha valores nas duas últimas casas desprezadas.  

Fonte: Cecilia Camargo Rosario -  Consultora da Atitude Desenvolvimento Empresarial